Takuya Hidaka Website

研究活動

経歴:

2016年    京都大学理学部卒業
2018年    京都大学大学院理学研究科化学専攻(生物化学研究室、杉山弘教授) 修士課程修了
2018-2021年  日本学術振興会特別研究員(DC1)
2021年    京都大学大学院理学研究科化学専攻(生物化学研究室、杉山弘教授) 博士課程修了

2021年-現在  日本学術振興会特別研究員(PD)
2021年-現在  理化学研究所生命機能科学研究センター 訪問研究員
2021年-現在  京都大学高等研究院 客員研究員


Research:

 ピロールイミダゾールポリアミドはN-メチルピロールとN-メチルイミダゾールからなる化合物であり、塩基配列選択的にDNAの副溝に結合する性質を持っています。現在京都大学理学研究科生物化学研究室において杉山弘教授の指導のもと、このピロールイミダゾールポリアミドを用いて遺伝子発現やDNA複製の人為的制御を可能にする化合物の開発を行っています。(~2021年3月)


Publications:

論文

1. Creation of a Synthetic Ligand for Mitochondrial DNA sequence Recognition and Promoter-Specific Transcription Suppression
Hidaka, T.; Pandian, G.; Taniguchi, J.; Nobeyama, T.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 8444-8447. (Front cover)

2. A Synthetic DNA-binding Inhibitor of SOX2 Guides Human Induced Pluripotent Stem Cells to Differentiate into Cardiac Mesoderm
Taniguchi, J.; Pandian, G.; Hidaka, T.; Hashiya, K.; Bando, T.; Kim, K. K.; Sugiyama, H.
Nucleic Acids Res. 2017, 45, 9219-9228.

3. Biomimetic Artificial Epigenetic Code for Targeted Acetylation of Histones
Taniguchi, J.; Feng, Y.; Pandian, G.; Hashiya, F.; Hidaka, T.; Hashiya, K.; Park, S.; Bando, T.; Ito, S.; Sugiyama, H.
J. Am. Chem. Soc. 2018, 140, 7108-7115.

4. Targeted Suppression of Metastasis Regulatory Transcription Factor SOX2 in Various Cancer Cell Lines using a Sequence-specific Designer Pyrrole-imidazole Polyamide.
Malinee, M.; Kumar, A.; Hidaka, T.; Hirose, M.; Hasegawa, K.; Namasivayam, P. G.; Sugiyama, H.
Bioorg. Med. Chem. 2020, 28, 115248.

5. Enhanced nuclear accumulation of pyrrole-imidazole polyamides by incorporation of tri-arginine vector.
Hidaka, T.; Tsubono, Y.; Hashiya, K.; Bando, T.; Namasivayam, P. G.; Sugiyama, H.
Chem. Commun. 2020, 56, 12371-12374.

6. A Near-Infrared Fluorogenic Pyrrole-Imidazole Polyamide Probe for Live-Cell Imaging of Telomeres.
Tsubono, Y.; Kawamoto, Y.; Hidaka, T.; Pandian, G.; Hashiya, K.; Bando, T.; Sugiyama, H.
J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 17356-17363.

7. Photo-Controllable Phase Transition of Arylazopyrazole-Conjugated Oligonucleotides.
Hidaka, T.;# Wee, W. A.;# Yum, J. H.; Sugiyama, H.; Park, S. (#Co-first authors)
Bioconjugate Chem. 2021, 32, 2129-2133.

8. Targeted elimination of mutated mitochondrial DNA by a multi-functional conjugate capable of sequence-specific adenine alkylation.
Hidaka, T.; Hashiya, K.; Bando, T.; Pandian, G.; Sugiyama, H.
Cell Chem. Biol. 2022, 29, 690-695.

解説・総説

1. 人工遺伝子スイッチの創製を目指して―塩基配列選択的DNA結合分子を用いた新しい人工転写因子
日高拓也、杉山弘
月刊「化学」(化学同人) 74(1), 38-43.

2. Therapeutic Gene Regulation Using Pyrrole-Imidazole Polyamides
Yu, Z.; Pandian, G. N.; Hidaka, T.; Sugiyama, H.
Adv. Drug Deliv. Rev. 2019, 147, 66-85.

3. Sequence-Specific Control of Mitochondrial Gene Transcription using Programmable Synthetic Gene Switches called MITO-PIPs
Hidaka, T.; Sugiyama, H.; Pandian, G. N.
Methods Mol. Biol. 2021, 2275, 217-225.

4. Chemical approaches to the development of artificial transcription factors based on pyrrole–imidazole polyamides
Hidaka, T.; Sugiyama, H.
Chem. Rec. 2021, 21, 1374-1384. (Front cover)

 

書籍

1. Sequence-Specific DNA Binders for the Therapy of Mitochondrial Diseases
Hidaka, T.
Springer Thesis (Springer) 2022. ( ISBN: 978-981-16-8436-4 )

Conference:

1. 『第39回分子生物学会年会』 パシフィコ横浜、2016年12月

2. 『日本ケミカルバイオロジー学会第12回年会』 北海道大学、2017年6月

3. 『第97回日本化学会春季年会』 慶応義塾大学、2017年3月

4. 『2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)』 神戸ポートアイランド、2017年12月

5. “The 1st International Mitochondria Meeting for Young Scientists” コーポイン京都、2018年4月

6. “XXIII INTERNATIONAL ROUNDTABLE ON NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND NUCLEIC ACIDS” UC San Diego, US, 2018年8月

7. 『第99回日本化学会春季年会』 甲南大学、2019年3月

8. “10th World Congress on Targeting Mitochondria” Berlin, Germany, 2019年10月

9. 『第42回分子生物学会年会』 マリンメッセ福岡、2019年12月

10. 『第101回日本化学会春季年会』 オンライン開催、2021年3月

11. “Pacifichem2021” オンライン開催、2021年12月

Awards:

1. 優秀ポスター賞 第39回分子生物学会年会

2. 学生講演賞 第99回日本化学会春季年会

 3. Springer Theses Award (2021)

 4. 第38回 井上研究奨励賞 (http://www.inoue-zaidan.or.jp/b-01.html?eid=00049)

研究助成金:

1. 日本学術振興会特別研究員奨励費(FY2018-FY2020)、”ミトコンドリア病根治薬を目指した塩基配列選択的DNA結合能をもつ化合物の開発”

2. 日本学術振興会若手研究者海外挑戦プログラム(2018)、” 金ナノ粒子を用いた変異ミトコンドリアDNA複製阻害剤の開発 “ (派遣先:米国ラトガース大学, 派遣期間 : 2018年9月-2018年11月)

3. Young Researchers’ Exchange Programme between Japan and Switzerland (2019)、” Artificial control of mitochondrial DNA in mesenchymal stem cells by a sequence-selective DNA binder” (派遣先:AO research institute, Switzerland, 派遣期間 : 2020年2月-2020年3月)

4. 日本学術振興会特別研究員奨励費 (FY2021-FY2023)、”1分子蛍光観察による1細胞プロテオーム解析法の開発”

5. 科研費 若手研究 (FY2022-FY2023)、”1細胞リン酸化プロテオミクスによる細胞分化解析”

その他:

1. 平成27年度バイオインフォマティクス技術者試験認定試験 合格